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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Greetings,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">We're trying to install molpro,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Redhat/centos v5 machine,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Intel c++/fortran compilers (v12.0.4)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">We've tried installing the binary version,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">It returns "Kernel Too Old"<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">For the source-based install,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Even simple 'configure' options fail, e.g.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">./configure -icc -ifort<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I'd rather get the parallel 'molprop' version compiled and installed,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">but at this point, I'm trying to get the serial version working first.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Please help?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I've included verbose text / output below for reference.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">--Benji<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Benji Wakely <b.wakely@latrobe.edu.au><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">Unix Systems Administrator<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">La Trobe University<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">+613 9479 5499<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU">+614 34 307 667<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal">===========================================================<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">========== Screen output of attempted installation / STDOUT ==========<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">===========================================================<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">./configure -icc -ifort<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">machine type recognized as x86_64 (Generic 64-bit)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">kernel recognized as Linux<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">user request compiler ifort<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Intel Fortran Compiler, Version 12.0.4<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FC=/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/ifort<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">user request compiler icc<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Intel C compiler, Version 12.0.4<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CC=/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/icc<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Use BLAS library - Intel 64-bit Math Kernel Library (MKL) for Linux<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">BLASLIB=-L/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_sequential -lmkl_core<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter BLAS linking flags or [Enter] for above<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter max number of atoms [200] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter max number of valence orbitals [300] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter max number of basis functions [4095] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter max number of states per symmmetry [20] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter max number of state symmetries [16] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter max number of records [512] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Enter max number of primitives = maxbfn x [2] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Installation directory [/usr/local/molpro] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">bin directory (optional) [] :<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">unable to link with parse object using:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/ifort -i8 -r8 -pc64 -auto -vec-report0 -warn nousage -cxxlib -O0 -lpthread /usr/local/src/molpro/Molpro/src/boost-install/lib/libboost_system.a /usr/local/src/molpro/Molpro/src/boost-install/lib/libboost_thread.a
-lrt<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Please check the compiler is working, flags are correct and all libraries are present<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">failed to determine PARSE<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Result so far of configure written to CONFIG.errout<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">===========================================================<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">========== Contents of CONFIG.errout ==========<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">===========================================================<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"># MOLPRO CONFIG generated at Tue Feb 25 11:28:20 EST 2014, for host mumblemumble.latrobe.edu.au, SHA1=6bd356935ff1944eb5ed2fa83068fc06e9d3b7e1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">CONFIGURE_OPTIONS="-icc" "-ifort"<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">AR=ar<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ARCHNAME=Linux/x86_64<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ARFLAGS=-rS<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">AWK=awk<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">BIBTEX=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">BLASLIB=-L/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_sequential -lmkl_core<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">BUILD=s<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CAT=cat<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CC=/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/icc<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CCVERSION=12.0.4<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CC_FRONT=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CDEBUG=-g $(addprefix $(CDEFINE),_DEBUG)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CDEFINE=-D<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CFLAGS=-ftz -vec-report0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CLDFLAGS=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CLEAN=echo 'target clean only available with git cloned versions, please unpack the tarball again'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CMPPINCLUDE=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">COPT=-O2<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">COPT0=-O0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">COPT1=-O1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">COPT2=-O2<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">COPT3=-O3<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CP=cp -p<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CPROFILE=-p<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACC=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACCVERSION=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACDEBUG=-g $(addprefix $(CUDACDEFINE),_DEBUG)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACDEFINE=-D<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACFLAGS=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACOPT=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACOPT0=-O0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACOPT1=-O1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACOPT2=-O2<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACOPT3=-O3<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CUDACPROFILE=-p<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CXX=/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/icpc<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CXXFLAGS=$(CFLAGS)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">DOXYGEN=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ECHO=/bin/echo<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">EXPORT=export<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">F90FLAGS=-stand f03 -diag-disable 5268<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FC=/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/ifort<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FCVERSION=12.0.4<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FDEBUG=-g $(addprefix $(FDEFINE),_DEBUG)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FDEFINE=-D<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FFLAGS=-i8 -r8 -pc64 -auto -vec-report0 -warn nousage -cxxlib<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FLDFLAGS=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FOPT=-O3<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FOPT0=-O0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FOPT1=-O1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FOPT2=-O2<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FOPT3=-O3<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FPROFILE=-p<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">FSTATIC=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">HOSTFILE_FORMAT=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">INSTALL_FILES_EXTRA=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">INSTBIN=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">INST_PL=0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">INTEGER=8<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LAPACKLIB=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LATEX2HTML=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LAUNCHER=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LD_ENV=/usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/compiler/lib/intel64 /usr/local/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LD_ENVNAME=LD_LIBRARY_PATH<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LIBRARY_SUFFIX=a<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LIBS=-lpthread /usr/local/src/molpro/Molpro/src/boost-install/lib/libboost_system.a /usr/local/src/molpro/Molpro/src/boost-install/lib/libboost_thread.a -lrt<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">LN=ln -s<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MACROS=MOLPRO NDEBUG MOLPRO_f2003 HAVE_BOOST_THREADS HAVE_SSE2 _I8_ MOLPRO_INT=8 BLAS_INT=8 LAPACK_INT=8 MOLPRO_AIMS MOLPRO_NECI MOLPRO_BLAS MOLPRO_LAPACK<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MAKEDEPEND_OPTIONS=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MAKEINDEX=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MAPLE=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MAX_INCREMENT_LIBRARY=0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MKDIR=mkdir -p<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MODULE_FLAG=-I<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MODULE_SUFFIX=mod<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MPILIB=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MPPLIB=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">OBJECT_SUFFIX=o<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">OPT0=copyc6.F<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">OPT1=explicit_util.F<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">OPT2=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">OPT3=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PAPER=a4paper<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PARSE=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PDFLATEX=<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PNAME=molpros_2012_1_Linux_x86_64_i8<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PREFIX=/usr/local/molpro/molpros_2012_1_Linux_x86_64_i8<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PTSIZE=11<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PYTHON=/usr/bin/python<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RANLIB=ranlib<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RM=rm -rf<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">SHELL=/bin/sh<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">STRIP=strip<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">SUFFIXES=F F90 c cpp<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">TAR=tar -cf<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">UNTAR=tar -xf<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">VERBOSE=@<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">VERSION=2012.1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">XSD=/usr/bin/xmllint --noout --schema<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">XSLT=/usr/bin/xsltproc<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">YACC=bison -b y<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">.SUFFIXES:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MAKEFLAGS+=-r<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ifneq ($(LD_ENVNAME),)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">$(LD_ENVNAME):=$(LD_ENV):$($(LD_ENVNAME))<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">endif<o:p></o:p></p>
</div>
</body>
</html>